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你问我答 | MGISEQ-2000RS FluoXpert

时间:2024-10-12作者:华大智造阅读数:770分享

《你问我答》栏目搜集了华大智造客户的常问问题,并为大家整理出了不同产品的FAQ,后续将陆续发布,帮助您更好地了解和使用我们的产品。

文章导览:

Q1:MGISEQ-2000RS FluoXpert升级后新增了哪些功能?

Q2:MGISEQ-2000RS FluoXpert的产品构成是什么?

Q3:MGISEQ-2000RS FluoXpert的多重染拍功能有什么优势?

Q4:MGISEQ-2000RS FluoXpert的基因测序功能有什么优势?

Q5:已购置MGISEQ-2000RS的用户如何升级到FluoXpert?

Q6:MGISEQ-2000RS FluoXpert的染色轮数和最佳通量如何进行计算?

Q7:FluoXpert上的产出的结果是什么图片格式?

Q8:FluoXpert Vision分析平台可以给出什么样的分析结果?

Q9:MGISEQ-2000RS FluoXpert如何切换测序和免疫荧光模式?

Q10:MGISEQ-2000RS FluoXpert染色载片的有效扫描面积是多少?


Q1:MGISEQ-2000RS FluoXpert升级后新增了哪些功能?

MGISEQ-2000RS FluoXpert是一款融合高通量测序技术(MPS)和多重免疫荧光技术(mIF)的多功能一体机,只需通过软件切换即可实现测序与染色的功能转换。FluoXpert在MGISEQ-2000RS硬件基础上进行软件升级,配套高效稳定的多重免疫荧光试剂套装,可在单个组织切片上检测多个目标蛋白并保留空间信息,与基因测序形成技术互补,为肿瘤免疫微环境提供更准确、更全面、更高效的评估依据,助力病理研究。


Q2:MGISEQ-2000RS FluoXpert的产品构成是什么?

MGISEQ-2000RS FluoXpert是一台集基因测序和多重免疫荧光染色的多功能机型;配备测序软件和FluoXpert多重免疫荧光染拍软件,通过软件切换实现功能切换。用户可根据需要选购配套的FluoXpert多重免疫荧光试剂套装,和多重免疫荧光图像分析平台FluoXpert Vision。


Q3:MGISEQ-2000RS FluoXpert的多重染拍功能有什么优势?

MGISEQ-2000RS FluoXpert样本兼容性高,支持新鲜冰冻组织或FFPE样本上机;兼容市售抗体,无需过多的预处理,染色、拍照全自动完成,可以在一张组织切片上检测多种生物标志物的表达水平并保留空间信息。与配套的FluoXpert多重免疫荧光试剂套装搭配使用,MGISEQ-2000RS FluoXpert支持3-24种标志物(marker)的检出,可广泛应用于肿瘤分型、预后评估、肿瘤微环境、神经科学、转化医学研究等。基于染拍一体化、系统化和模块化的设计理念,MGISEQ-2000RS FluoXpert的上机流程更加便捷快速。而且,在配套的FluoXpert多重免疫荧光试剂套装中,集成了自发荧光去除试剂,简化了上机前样本处理步骤;节省抗体用量,较传统手动免疫组化检测,MGISEQ-2000RS FluoXpert的抗体用量可降低约2.5-5倍,有效节约试剂成本。MGISEQ-2000RS FluoXpert的操作稳定性高,上机染色效果与金标准IHC染色效果无显著性差异,优化的拼接算法及成像技术可以实现亚细胞水平分辨率的全景成像效果。


Q4:MGISEQ-2000RS FluoXpert的基因测序功能有什么优势?

MGISEQ-2000RS FluoXpert的多重染色功能与其测序功能互不影响、互为补充。与常规的蛋白染拍一体机相比,MGISEQ-2000RS FluoXpert的测序数据可以为染拍结果提供一步到位的分子检测数据作为补充或参考;与常规的基因测序仪相比,MGISEQ-2000RS FluoXpert的测序性能优越,支持多种测序读长,通量灵活(55Gb-1440Gb),支持不同规格的测序载片独立运行,能全面满足广泛的测序需求,是国内外测序实验室的首选机型之一。


Q5:已购置MGISEQ-2000RS的用户如何升级到FluoXpert?

已购置MGISEQ-2000RS的用户仅需订购【多组学升级包】即可,无需重新购机。多组学升级包的构成是:多重免疫荧光染拍软件和多重免疫荧光图像分析平台FluoXpert Vision(选配)。

配套的FluoXpert多重免疫荧光试剂套装用户可根据实验需要,按需购买。目前,MGISEQ-2000RS FluoXpert的配套试剂提供2个版本:标准版(6-plex,24-plex)和定制版(因项目需求而异,可在3-24plex范围内进行选择)。

FluoXpert多重免疫荧光试剂套装(标准版)包括:多重免疫荧光试剂盒,以及FluoXpert染色载片。考虑到不同尺寸切片样本的染拍需要,MGISEQ-2000RS FluoXpert提供三种可选的载片规格,包括:

-SS(Solo Small,适用于小切片):适合小块组织切片,如穿刺小组织,速度更快。

-SL(Solo Large,适用于大切片):适合大块组织切片,如扁桃体,大肿瘤,面积、视野更大。

-DL(Dual Large,适用于双切片共染):一个载片可贴两块切片,适合批量染色,节省试剂和时间。


Q6:MGISEQ-2000RS FluoXpert的染色轮数和最佳通量如何进行计算?

以标准版试剂盒(6-plex)为例,MGISEQ-2000RS FluoXpert完成6标7色染拍工作需要进行3轮抗体染色和1轮核染色(每循环单染色载片可完成2个标志物进行计算),总共4个循环,总用时约4小时。最佳通量的计算是按照一周5个工作日,每天8小时工作时间进行计算,即:每个工作日可以完成2次上机运行且每次运行2张染色芯片,双载物台可同时或滚动上机,每周工作时间可完成2*2*5=20张切片(SS/SL载片),4*2*5=40张切片(DL载片)。


Q7:FluoXpert上的产出的结果是什么图片格式?

FluoXpert下机数据为拼接完成的全景扫描图像。该图像会对连续的组织区域进行裁剪(可选)并可根据需求输出不同的压缩格式(OME-TIFF,TIFF,JPEG,PNG,BMP)。


Q8:FluoXpert Vision分析平台可以给出什么样的分析结果?

FluoXpert Vision分析平台可以提供图片的可视化及标注,根据标志物阈值进行阳性细胞数定量分析,根据多标志物表达情况进行细胞表型分析,以及邻近细胞群空间位置分析。


Q9:MGISEQ-2000RS FluoXpert如何切换测序和免疫荧光模式?

目前仪器无法兼容测序和免疫荧光软件同时启动。需将一方完全关闭后才能启动另外一个软件。


Q10:MGISEQ-2000RS FluoXpert染色载片的有效扫描面积是多少?

SS染色载片的扫描面积为15mm*15mm,SL染色载片的扫描面积为15mm*20mm,DL染色载片的扫描面积为15mm*20mm*2。


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