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用户测评 | 海希生物基于华大智造G99测序仪推出HLA分型检测方案

时间:2024-10-21作者:华大智造阅读数:722分享

HLA精准分型检测为移植配型提供了重要理论依据,供者与受者HLA高分辨相合的移植可以提高患者的生存率,降低移植物抗宿主病发生机率。采用分子生物学手段对HLA进行分型检测已广泛应用于临床医疗服务,如异体器官移植、造血干细胞移植、安全输血,以及各种疾病关联和药物基因组学应用中。


为了准确鉴定HLA分型,提升检测的准确率,海希生物基于华大智造DNBSEQ-G99测序平台推出HLA分型检测产品-HLA高分辨分型17位点检测试剂盒(高通量测序),该产品采用杂交捕获法,在G99平台快速、灵活、简单的优势助力下,通过一次实验与检测,可同时准确、快速获取17个HLA等位基因的四位数分型结果。


01 产品方案


海希生物HLA分型检测产品针对HLA的17个基因进行检测,每个基因的目标区域设计加密探针,全面覆盖完整的外显子区域。HLA分型检测产品可兼容多种样本类型,包括外周血、口腔拭子、骨髓、脐带血等。该产品包含的具体基因及类别见下表。


表1 海希生物HLA分型检测产品覆盖基因展示



02 检测流程



图1 海希生物HLA分型检测流程


03 探针性能


1.海希研发团队自主设计探针,充分考虑基因的多态性,实现对所有型别的有效捕获,并根据最新IMGT_HLA 3.52数据库进行探针补充,保证型别准确报出。


2.采用非重叠平铺式探针设计,利用6000多条探针即可捕获约216kb目标区域,且捕获均一性极好,如左下图所示为本次测试的16例样本所有位点的平均测序深度均在200左右,右下图即可直接展示出覆盖度的均一性情况。



图2 海希生物HLA共16个样本覆盖度展示


04 测试结果


1.海希生物HLA分型检测方法与PCR-SBT检测方法分型结果比对

选用UCLA室间质评标准品共16例,利用海希生物HLA分型检测流程进行检测,同时对这16例样本进行PCR-SBT分型检测。对样本整体检测结果评估,结果表明,海希生物通过G99测序的HLA分型检测的分型结果与PCR-SBT分型结果比对一致,符合率达到100%。分型检测中,使用的试剂盒产品包含:1)海希生物HLA 高分辨分型17 位点检测试剂盒(NGS);2)940-001647-00 DNBSEQ 一步法DNB制备试剂盒 V4.0 OS-App 4 Rxn/Kit;3)940-000413-00 DNBSEQ-G99RS高通量测序试剂套装(G99 SM App-C FCL PE150)。具体分型结果见附录。


表2 海希生物HLA与PCR-SBT分型检测结果对比


2.海希生物HLA分型检测结果与室间质评提供的标准分型结果比对

同时,对于以上16个室间质评样本的HLA II类基因在G99上的检测结果与室间质评提供的标准分型结果比对,四分位分型完全一致(见下表)。


表3 HLA与标准分型检测结果对比


05 海希生物HLA产品分析亮点


1.HLA基因多态性与人类多种疾病和用药具有高度相关性:结果可展示CPIC指南用药相关型别和常见疾病相关型别。


2.根据IMGT/HLA网站,结果可提示受/供者HLA-B先导基因型和移植后患GVHD风险。



图3 HLA基因与疾病相关性


06 海希生物HLA产品特点总结


高效:自主设计探针捕获效率高,目标基因捕获区域覆盖均一性好。

准确:覆盖HLA低、中、高分辨分型,正确率100%。分型精度一般为4 位或者6位,最高可达8位精度分型,有效解决其他技术无法判定的模棱两可型别。

专业:专业研发和服务团队,可帮助客户发现新基因型别和开展后续科研工作。

经济:使用HLA高分辨分型17位点检测(高通量测序)项目试剂盒,支持大批量样本上机,能有效降低实验成本。


07 G99在HLA分型检测应用中的优势


1.24小时内完成HLA全流程检测

G99在12小时内即可完成PE150测序,显著缩短了检测的总时间。在移植医学或免疫学领域,快速的结果反馈能够为患者提供更迅捷的治疗决策。


2.简单便捷的操作流程

G99操作界面直观简洁,确保实验室人员能够方便、准确地进行检测,操作方法简单易学。


3.灵活多样的上机模式

G99的双载台设计,可随时开启测序工作,适应多样化的应用需求,同时实现检测的准确性和广泛性。

G99测序仪帮助用户在HLA分型检测的应用中24小时内极速获取准确的检测结果,为高通量测序技术在HLA分型检测拓展了更多的应用场景。2023年9月,G99已获批国家药品监督管理局(NMPA)医疗器械注册证,被准许在国内市场应用于临床,支持临床方向多种DNA和RNA基因检测应用需求。G99以其极致的测序速度、灵活简单的上机体验、高效多样的测序选择,持续赋能用户,助力行业发展。


附录


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