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上新 | 提速10小时?MGISEQ-2000升级大揭秘

时间:2022-08-05作者:华大智造阅读数:908分享

近日,华大智造对旗下中高通量基因测序仪MGISEQ-2000进行了全面升级,以提供更稳定的性能和更佳的使用体验。作为一款全能型桌面测序仪,MGISEQ-2000能够为用户提供全面、灵活、高效的测序选择,是大中型高通量测序实验室的优选机型。


MGISEQ-2000自发布以来,已经广泛应用于科学研究、疾病防控、环境、农业等多种领域,累计发表文章560余篇,助力科研领域高通量测序技术的全面普及。华大智造深耕生命科学工具研究和平台建设,近期对MGISEQ-2000 的控制软件、算法软件及配套脚本进行了升级,给客户带来更快速,更简单,更灵活的测序体验!


更快速大载片提速20%


PE150测序模式下,MGISEQ-2000运行2张FCL载片可产生>1 Tb碱基数据,这个夏季,MGISEQ-2000重磅升级,搭配新版本测序试剂即可提速!在保质保量的基础上FCL 载片PE100的测序时间*从48h缩短至38h,FCL 载片PE150则从原来的66h缩短至56h,分别实现了20%左右的提速。


图1  FCL提速(PE100和PE150)

注:运行时间根据双载片进行统计,包括:样本加载、测序和写FastQ时间


更简单碱基不再需要如此“Balance”


通过算法优化,MGISEQ-2000对碱基不平衡文库更加友好,即使单个barcode也能实现很好的拆分。如下图2所示,采用NA12878样本,进行PCR-Free WGS建库,文库在升级后的MGISEQ-2000上进行测序,数据显示单个barcode样本和两个barcode样本的SplitRate均达到98%以上,满足少数样本的灵活测序和拆分。


图2 MGISEQ-2000升级前后SplitRate(%)对比


甲基化文库是典型的不平衡文库,测序时为了实现更准确的碱基信号识别往往需要添加一定比例的平衡文库进行碱基平衡。MGISEQ-2000升级后,在不添加平衡文库的基础上进行WGBS测序,拆分率可达96%,相较升级前(60.39%)提升了将近60%,详见下图3;同时,对比分析了添加25%平衡文库和不添加平衡文库的测序表现情况,可以看出是否添加平衡文库对MGISEQ-2000测序产出的数据量没有显著影响(图4)。


图3  MGISEQ-2000升级前后甲基化文库(不加平衡文库)的SplitRate(%)对比


\图4 MGISEQ-2000升级后甲基化文库(不同比例平衡文库)的数据量对比


更灵活双模测序,随时上机


MGISEQ-2000搭载双载台,每次运行支持1-2张载片上机,升级后更可实现双模测序*——即AB边单独测序,间隔时间随意,在测序中途亦可添加第2张载片变为双载片运行模式;双载片独立运行,测序数据独立下机,进一步缩短TAT(turn around time),使测序无需等待,只等“样”来,随来随测,一台仪器可当“两台”使用,提高测序仪的使用效率。


图5 单双载片测序模式切换示意图

注:目前双模功能仅针对RUO 仪器(MGISEQ-2000RS)开放,不适用于IVD 仪器(MGISEQ-2000)


预告关于此次升级,如有任何问题可联系当地销售或拨打4000-966-988客服热线!


此外,华大智造PE300快速测序试剂套装即将上市,升级后的MGISEQ-2000搭配PE300快速测序试剂套装可用于微生物16S/18S/ITS测序。


更多精彩,敬请期待!

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