您现在的位置: 首页 /  资讯

上新 | 助力海关病媒监测:基于MGISEQ-200的病媒物种及微生物识别组合产品

时间:2023-03-01作者:华大智造阅读数:5961分享

“建立全球传染病疫情信息智能监测预警、口岸精准检疫的口岸传染病预防控制体系和种类齐全的现代口岸核生化有害因子防控体系,建立基于源头防控、境内外联防联控的口岸突发公共卫生事件应对机制,健全口岸病媒生物及各类重大传染病监测控制机制,主动预防、控制和应对境外突发公共卫生事件。”

——摘自中共中央、国务院印发的《“健康中国2030”规划纲要》


输入性病媒生物引发的各种传染病是世界性公共卫生问题之一,全球一体化为病媒传染病的传播提供了机会。因此,为减少输入性病媒物种对公共卫生和生态的威胁,作为一国之门的海关口岸,具备及时、精准监测病媒物种及其携带微生物的能力非常重要。


目前口岸现有的输入性病媒生物的传统形态识别方法存在很多困难,如无法识别若虫、卵等非成虫态病媒、肢体残肢不全的昆虫、雌虫及近缘种,在识别过程中由于缺少参考资料和参比标本、数据共享性差以及缺少形态鉴定专家等原因,无法准确快速鉴定。


采用高通量测序技术对病媒生物监测,能够快速、精准地识别输入性病媒生物的物种及近缘种,解决物种识别受虫态和虫体不完整等限制问题,可减少病媒生物本身及其携带病原体的扩散机会。




为此,针对海关病媒物种的监测,华大智造基于MGISEQ-200测序平台,特别提供了病媒物种及微生物识别组合产品,该组合产品有以下特点:


01

一站式快速、精准检测

覆盖从样本到报告全流程,一次实验即可同时识别病媒生物物种及其携带微生物,为出入境检验检疫和病媒防控提供全套工具支撑。


02

为工作人员降低操作门槛

包含丰富的物种数据库和强大的分析功能,覆盖9类病媒生物的DNA条形码数据库,并收录细菌、真菌、病毒等2万多种微生物数据(可定期更新),简单操作即可自动生成病媒物种及其携带微生物的识别分析报告。



测试报告结果展示

以12例病媒模拟样本为例(含6例DNA样本、6例RNA样本),采用华大智造病媒测序组合产品,对病媒物种及其携带微生物的类型进行精准识别。识别结果包括但不限于:病媒物种识别结果、病媒生物线粒体组装序列深度分布图、病媒所携带的微生物类型识别等。这些结果的输出,对于海关工作人员而言,可以精准判断病媒物种及其携带微生物类型,以快速应对境外突发公共卫生事件。


结果1:

病媒物种识别

对12例样本进行检测,系统自动输出物种识别结果及线粒体的组装序列,混合样本输出2条结果,所有样本的病媒物种识别结果完全符合预期。


表1:病媒物种识别结果



结果2:

病媒生物线粒体组装序列深度分布图

该组合产品可对每份样本中比对到物种线粒体基因组的序列进行组装,再将组装后的序列中比对到数据库中的COI参考序列做深度分析,以S2样本为例,深度分布如图1所示。


图1 样本S2的组装序列深度分布图


结果3:

病媒所携带的微生物类型识别

对样本中所携带的微生物物种进行识别,以S1样本为例,结果如表2所示,识别结果符合预期,目标微生物均被识别出,其他非目标微生物为病媒样本自身携带的其他微生物。


表2 样本S1的微生物识别结果



总结
对病媒生物及其携带微生物的及时有效监测是口岸公共卫生防控的重要工作。基于MGISEQ-200测序平台的病媒物种及微生物识别组合产品,具有识别结果准确、分析功能丰富、操作简便的特点。此外,华大智造也可提供基于DNBSEQ-G99测序平台的适配方案,以满足用户需要进一步缩短检测时间的应用需求。


总而言之,华大智造病媒监测组合产品覆盖了从样本到报告的全工作流程,一次实验可同时完成病媒生物物种及其携带微生物类型的识别,为出入境检验检疫和病媒传染病防控提供了强大的工具支撑。


版权所有©2024 深圳华大智造科技股份有限公司 隐私政策法律声明
互联网药品信息服务资格证书[(粤)-非经营性-2024-0050] 粤ICP备16117185号粤公网安备号 44030802000485
本网站使用的cookies
我们希望使用必要的cookies来执行网站运行的基本功能。我们还希望设置分析cookies和广告cookies,通过评估您如何使用我们的网站来帮助我们进行改进。有关在本网站上使用cookies等详细信息,请参阅我们的隐私政策
仅接受必要的cookies接受全部cookies