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强化海洋环境监测!华大智造提供高效eDNA测序工具

时间:2023-09-19作者:华大智造阅读数:2823分享

据我国生态环境部,我国正扎实推进陆海污染治理、环境风险防范等重点任务,并不断强化海洋环境监测。


对核污染水排海后的海洋生态环境进行监测尤为重要。核污水中含有多种放射性元素,可能导致生物发育异常、致死或繁殖能力下降,从而影响种群数量和生物多样性,扰乱整个生态系统的平衡,对生态系统的结构和功能产生不可逆的影响,并对人类的生存与健康造成威胁。



环境DNA:

用海中舀起的一杯水实现生态环境的监测


海洋生态环境监测内容包括但不限于水质、土壤、大气和生物等方面,最重要的是对核污染水排放区域的生物多样性进行监测。生物是环境的敏感指示物种,对环境污染具有较高的敏感性,且放射性核素沉积在生物体内会造成遗传物质DNA的损伤和断链进而诱发变异与癌症,通过监测生物的生存状况和物种多样性等指标可以评估核污染水排放对生物群落的影响为污染治理和生态系统保护提供依据。


只需从海中舀一杯水,从土壤中挖一抔土,从沉积物中分离一管淤泥等等,就能知道有哪些物种曾在附近出没。这就是环境DNA(eDNA)技术。


环境DNA技术是20 世纪以来生态环境领域最重要的革命性技术之一,已成为生物监测和保护的重要工具。它通过从环境介质(水、土壤、沉积物等)中提取DNA,对基因组的特定DNA片段进行PCR扩增和高通量测序,从而实现对生物群落的定性、定量分析。



图1:核污染水排放的影响以及eDNA检测的必要性



超快速、更灵敏!

华大智造将推出环境DNA宏条形码测序组合产品


高通量测序的灵敏度优势可以对环境中含量非常低的DNA实现检测。采用基于高通量测序的环境DNA技术,研究人员可以在一个样本中同时分析数千个物种。它极大地变革了生物多样性的发现和监测手段,可以高通量地检测和量化生物多样性及其变化,为评估环境污染对生态系统的风险提供了更有效的方法。


高通量测序与eDNA序列相关联的技术也被称为“eDNA metabarcoding”(环境DNA宏条形码)。目前,华大智造基于ATOPlex多重PCR技术和DNBSEQ测序平台正在开发一套环境DNA宏条形码测序组合产品,搭配自主研发的自动化样本制备系统与分析软件,可覆盖从样本到分析结果全流程,实现环境DNA一站式监测。


华大智造独有的DNBSEQ测序技术,能够为eDNA的生信分析提供高质量的测序数据。ATOPlex多重PCR 技术,是华大智造自主研发的超高重 PCR 核心专利技术,可针对目标区域进行引物设计,并提供Panel和建库试剂等一整套方案,实现精准高效的环境DNA宏条形码测序。


华大智造环境DNA宏条形码测序组合产品可实现识别环境样本(水体、土壤和沉积物等)中的微生物、植物、藻类和动物种类,具有不损害生物机体、不受生物发育时期限制、灵敏度高、物种覆盖广、分析功能强大等特点,为核污水排海后的生态系统生物多样性监测提供强大工具支撑。



图2:正在开发的华大智造环境DNA宏条形码测序组合产品


参考文献:Environmental DNA Time Series in Ecology. Trends in Ecology & Evolution, 2019.

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