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抗击流感!华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合助力精准溯源

时间:2023-11-29作者:华大智造阅读数:1672分享

国务院联防联控机制指出,今年10月以来,我国流感、肺炎支原体感染活动逐步增强,预计流感将出现全国冬春季流行高峰,肺炎支原体感染未来一段时间在部分地区仍将持续高发。各地要统筹做好新冠、流感和诺如病毒胃肠炎等重点传染病监测,密切跟踪疫情形势变化。


近日,广州医科大学附属市八医院传染病研究所基于华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合,对样本进行精准的流感病毒亚型识别,获得了完整的流感病毒基因组序列,成功对流感病毒进行测序和溯源。


此次流感溯源研究采用MGIEasy呼吸道微生物基因组建库试剂盒套装对40例流感阳性样本进行文库构建,在MGISEQ-2000上进行测序,搭配华大智造自主研发的FluTrack软件进行数据处理,对样本全基因组的8个片段进行比对。结果表明,40例样本中,36例样本(占比90%)的流感基因片段比对率超过95%,表现出优异的基因组测序覆盖度。


作为较易发生突变、而且传染性较强的高发病率病毒,流感病毒不仅难以辨别于普通感冒,还会与新型冠状病毒的交叉流行带来叠加效应负担。利用高通量测序技术对流感病毒变异进行追踪,对新型流感病毒做出预警,对流感流行趋势进行监测非常重要。


采用华大智造推出的呼吸道微生物基因组测序产品组合,能够对样本进行精准的流感病毒亚型识别,获得完整的流感病毒基因组序列,有助于疾控部门或科研机构对流感病毒的追踪和溯源等工作的高效开展和快速推动。



图1:华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合


其中,MGIEasy呼吸道微生物基因组建库试剂盒套装是华大智造采用ATOPlex多重PCR技术开发而成,能够对甲型流感和乙型流感病毒全基因组进行高效地扩增和文库制备;搭配华大智造DNBSEQ测序平台完成测序,并使用MGI FluTrack基础分析系统,可实现对流感病毒的分型、基因组组装和溯源研究。



图2:华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合提供多种通量方案


华大智造呼吸道微生物基因组测序产品组合,自动化程度高,数据质量优异,软件功能强大,能够为流感的变异监测和流行病学调查提供强大的工具支撑。


未来,秉承“创新智造引领生命科技”的理念,在公共卫生应用领域,华大智造将持续致力于满足病原微生物全基因组测序、靶向测序和宏基因组测序全流程等应用场景的需求,为公共卫生事件的监测和预警提供更自动、更便捷、更高效的国产化核心工具。

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