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单细胞研究新篇章:MGIEasy组织保存液与升级版单细胞3’RNA文库制备试剂全新发布

时间:2024-03-29作者:华大智造阅读数:3947分享

2024年3月29日,华大智造在第二届国际单细胞及空间组学大会上,正式发布其单细胞领域的最新产品MGIEasy组织保存液,以及全新升级的3’RNA-V3.0文库制备试剂盒。也意味着,华大智造DNBelab C系列单细胞产品家族迎来样本处理环节新成员,可护航珍贵样本在72h内保持基因表达完整性。此外,历经6年,三代产品迭代,此次也迎来了性能极致优化的3’RNA文库制备试剂盒V3.0。


图1. MGIEasy组织保存液及3’RNA-V3.0文库制备试剂盒


MGIEasy组织保存液的发布填补了华大智造在样本保存环节的试剂空白,进一步为单细胞研究者提供了更完善的一站式单细胞工具,满足单细胞研究发现过程中的全部湿实验环节和数据处理流程。



图2. 华大智造单细胞系列产品全流程一站式平台



MGIEasy组织保存液全新上市


产品简介

该组织保存液可以用于新鲜组织样本的低温存储和运输,在低温(2-8℃)条件下,可在72h内维持新鲜离体组织的细胞活性和稳定组织中的基因表达水平;保存的组织可以用于制备高质量的单细胞悬液,可应用于单细胞测序、细胞培养等;


产品特点

  • 在2-8℃,72h内稳定维持新鲜组织的细胞活性;
  • 快速渗透新鲜的组织样本,减少离体后组织基因表达的变化;
  • 有效避免收集多个样本时的批间差异;
  • 适配单细胞测序技术产出高质量数据;


图3. MGIEasy组织保存液



实测数据


图4. 组织保护液处理72h后小鼠多个组织解离细胞活率


表1. 小鼠脾脏为例组织保存液处理不同时间细胞质量和数量


图5. 使用RT-qPCR方法分析小鼠9个组织的8个应激相关的基因检测


图6. 组织保存液用于单细胞测序技术



单细胞3’RNA文库制备试剂盒V3.0

全新升级


产品简介

在单细胞产品领域,华大智造在2019年率先发布了DNBelab C系列产品,已收获了众多企业及科研用户的好评。2023年7月,华大智造发布了单细胞液滴生成仪DNBelab C-TaiM 4,为细胞或细胞核的分离和标签提供稳定的动力。


今天,在多组学建库方面,华大智造开发了第三代3’RNA文库制备试剂盒,试剂盒套装包括液滴生成、高通量文库制备、样本标签和加样载片共4个模块,5个子盒,产品性能得到了极大提升,单载片最多可以捕获2万个细胞,基因中位数PBMC、鼠脑细胞核等样本均可以达到2500。


图7. DNBelab C系列 高通量单细胞RNA文库制备试剂盒套装V3.0组成


图8. DNBelab C系列 高通量单细胞RNA文库制备试剂盒套装V3.0性能


升级亮点

  • 基因检出多,以PBMC为例提升60%以上,小鼠脑细胞核为例提升2倍以上;
  • 样本兼容广,低质量细胞、细胞核、原生质体均能产出良好数据;
  • 易用稳定,去掉繁琐的真空破乳和磁珠回收步骤,节省时间2h;
  • 经济友好,有效数据更多,测序需求的成本下降20%;


数据表现



图9. 部分样本数据表现


表2. PBMC样本升级前后对比



图10. PBMC升级前后基因和中位数对比(可以注释更多的中性细胞)


平台的重复实验稳定



图11. 人PBMC和鼠脑细胞核样本的重复实验


平台对比

与某海外平台对比,选取植物原生质体和哺乳动物肌肉细胞核为例,在细胞捕获效率上相当,均在50%以上,华大智造TaiM 4-V3.0版本在测序数据量更少的前提下,可以检测出更多的基因;人胃癌样本(数据来源吉因加)为例,和某主流平台细胞注释种类和比例高度一致,和某物种肌肉样本为例对比,可以检出更多低丰度基因和注释出更多细胞类型。



图12. 和某国际主流平台对比


值得一提的是,截至目前,基于华大智造单细胞平台,累计发表SCI论文65篇。其中,包含2篇Nature及2篇Cell主刊文章。



总结


华大智造副总裁、中国区总经理彭欢欢表示,华大智造推出单细胞领域新品——MGIEasy组织保存液,以及全新升级的3’RNA-V3.0文库制备试剂盒,将进一步完善了华大智造单细胞组学全流程产品家族,也将高效赋能全球生命科学实验室开启规模化、标准化的单细胞多组学研究。



图13. 华大智造副总裁、中国区总经理彭欢欢


未来,华大智造作为生命科技核心工具缔造者,将进一步深耕单细胞组学领域,致力于为所有生命科学实验室提供便携、经济、操作友好的单细胞组学全流程产品,助力行业开启大规模单细胞研究新时代。

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