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时空组学×华大智造丨时空转录组FFPE产品方案重磅发布,即日起开放订购!

时间:2024-06-28作者:华大智造阅读数:4280分享

6月28日,华大智造与时空组学相关业务主体达成合作,将获得时空组学产品的知识产权授权与全球市场经销权,为生命科学领域提供更丰富的核心工具。华大智造将负责制造并对外销售时空自动化样本处理系统、显微镜、时空可视化试剂套装,并成为时空组学试剂盒、芯片等试剂耗材产品的全球经销商。即日起,时空组学产品在华大智造同步开放订购!


近日,“创芯不止·探索无限”时空组学FFPE产品发布会成功举行。时空组学主任科学家廖莎正式发布了时空转录组FFPE产品方案,时空组学专项科学家张佳君在发布会现场启动了“见‘微’知著——华大时空组学中国区青年科学家激励计划”。


来自上海交通大学医学院附属瑞金医院病理科副主任医师笪倩、中南大学湘雅医院特聘副研究员张冠雄、中山大学附属第一医院消化内科李晓智博士等行业专家,分享了时空转录组FFPE产品方案在肿瘤、宿主及微生物互作等方向上的前沿应用。


与会嘉宾


华大生命科学研究院副院长方晓东为本次发布会致辞。他指出,技术革新是社会发展的引擎,时空组学技术为生命科学领域创新发展提供了引擎。本次发布的时空转录组FFPE产品方案,创新之处在于其随机引物技术,它不仅能捕获宿主RNA,还能捕获微生物RNA,为深入探索宿主与微生物的相互作用提供了强大工具。最后,他期待能够携手更多科研机构,共同推动科技创新,促进科学发展,将科技的福祉带给全人类。



华大生命科学研究院副院长方晓东



开辟病理研究新维度


工欲善其事,必先利其器。自2020年发布了具有“纳米级分辨率”与“厘米级全景视场”等突破性优势的时空组学技术Stereo-seq,华大时空组学持续基于科研应用场景和用户需求,陆续推出了时空转录组+H&E染色、时空转录组兼容多重免疫荧光、时空蛋白转录组Stereo-CITE等产品解决方案,进一步完善时空组学技术在科研领域的全链条赋能能力,加速生命科学研究领域的突破创新。


福尔马林固定的石蜡包埋(Formalin-Fixed Paraffin Embedded,FFPE)样本因其易于保存且能较好地保存样本组织形态的特点,在全球医学与科研领域被广泛应用。然而FFPE样本制备过程中,RNA可能存在降解,这导致Poly T探针无法捕获,且靶向探针的应用场景受限,因此亟需新的技术方法探究FFPE样本的组学奥秘。


本次发布的时空转录组FFPE产品方案,利用“随机探针”对FFPE样本中组织细胞内的Total RNA分子进行原位捕获,并通过空间条形码(Coordinate ID,CID)还原回空间位置,可实现全物种全转录组空间表达图谱的构建。


时空组学主任科学家廖莎,在发布会上展示了时空转录组FFPE产品方案的技术性能及优势。该产品可在同一张切片上实现H&E染色/细胞核染色和基因表达分析。结合纳米级捕获分辨率的优势,利用StereoMap可视化分析工具,用户可进行真正的空间单细胞水平分析。同时,全新的StereoMap还支持第三方细胞分割工具,以满足复杂且多样化的科学研究需求。



时空组学主任科学家廖莎


此外,与常见转录组方案相比,时空转录组FFPE产品方案还可捕获发生降解的RNA片段,也能实现编码及非编码RNA的共捕获,以及宿主与微生物的共检测。



拓展多元科研应用场景


时空转录组FFPE产品方案可应用在疾病研究、细胞图谱、生物标志物研究、宿主与微生物互作研究、非编码RNA调控研究等领域。本次发布会上,来自行业内的三位专家分享了该产品方案在肿瘤、宿主及微生物互作等方向上的前沿应用。


上海交通大学医学院附属瑞金医院病理科副主任医师笪倩,分享了时空转录组FFPE产品方案与数字智慧病理结合的应用案例。笪老师阐述了数字智慧病理的临床现状、时空淋巴瘤智能诊断平台的设计,以及淋巴瘤时空转录组FFPE预实验数据。笪老师深入探讨时空组学技术与人工智能诊断结合,具有提高病理诊断的效率和准确性的临床应用潜能。她表示,时空组学技术不仅提高了数据的科学性,也为回顾性临床试验提供了坚实的数据基础,推动了个性化诊疗的发展。


上海交通大学医学院附属瑞金医院病理科副主任医师笪倩


中南大学湘雅医院特聘副研究员张冠雄,分享了多模态数据整合和机器学习在皮肤疾病,尤其是银屑病治疗中的应用。他指出了当前皮肤病治疗面对的挑战,寻找新的靶点是治疗皮肤病的关键。时空转录组FFPE产品方案能够以近似单细胞分辨率刻画皮肤组织细胞组分及空间分布,进而可以识别皮肤病中潜在的新治疗靶点。


中南大学湘雅医院特聘副研究员张冠雄


中山大学附属第一医院消化内科李晓智博士,在现场分享了时空转录组FFPE产品方案在宿主-微生物互作方面的研究。基于时空转录组FFPE,李晓智博士在研究中精确描绘肠道各层的显微结构和细胞分布,同时原位检测了微生物的空间分布和表达丰度。研究发现微生物与周围细胞的互作可以在一定程度上解释炎症性肠病的空间异质性,为阐明炎症性肠病等消化系统疾病的分子机制提供客观证据。



中山大学附属第一医院消化内科李晓智博士



赋能青年科学家研究创新


为助力青年科学家的科研发现,华大时空组学于2022年、2023年连续发起了两期“青年科学家激励计划”,累计为35个入选项目提供了科研支持。2024年激励计划再出发,时空组学专项科学家张佳君在本次发布会上,发布了“见‘微’知著——华大时空组学中国区青年科学家激励计划(第三期)”。



时空组学专项科学家张佳君


该计划旨在支持广泛的科研领域,包括但不限于各类疾病研究(动物模型研究、病原微生物研究等),并鼓励国内青年科研人员利用时空转录组FFPE产品方案进行微生物检测和宿主-微生物互作的科学研究。评审委员会最终将评选出5个科研项目,并为入选项目提供2-4个FFPE样本的时空转录组支持(芯片规格为1cmx1cm)。生化实验、测序和标准分析等服务和收费标准由华大时空组学生态合作伙伴提供。


时空组学照亮浩瀚生命,工具创新助力新质未来。华大时空组学在开发前沿技术工具的同时,也积极致力于推进全球科研合作和生态合作伙伴建设,打造时空生态圈。目前,华大时空组学已与海内外20多家生物科技公司达成合作,时空转录组FFPE产品方案也将在各生态合作伙伴开放订购。


未来,华大时空组学将继续开发通用且功能强大的工具,携手生态合作伙伴,共同助力广大科研工作者进行更广、更深层次的组学探索,在生长发育、生命演化、器官结构、疾病机制等研究领域取得创新突破,推动生命科学行业加速发展。


注:时空组学多款产品方案已在华大智造官网上线,时空转录组FFPE产品方案同步上新,点击“阅读原文”即刻了解。

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