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时空组学

高通量测序技术助力
时空组学的研究与应用

Applications

随着生命科学研究的日益深入,传统的单细胞测序技术已难以满足对深层次、多维度生命系统探索的需求。时空组学技术应运而生,成为细胞研究领域的新星,它融合时间与空间维度,精准捕捉细胞基因表达及其在组织中的动态交互,革新了我们对生命奥秘的理解。

华大作为生命科学前沿技术的主要推动者,在2020年年初发布了自主研发的时空组学技术Stereo-seq(Spatial Enhanced Resolution Omics-Sequencing),该技术凭借高分辨、大视场、多组学、全物种的优势,已成功应用于胚胎发育、疾病病理、肿瘤学、脑科学、植物科学等领域,助力科研人员在Cell、Science、Nature等国际顶级期刊上发表了多项科研成果。

时空组学

时空组学产品方案

产品方案对比

时空转录组FF产品方案(V1.3)

时空转录组FF V1.3 兼容mIF产品方案

时空转录组FFPE产品方案

时空转录组大尺寸芯片产品方案

时空蛋白转录组Stereo-CITE产品方案 V1.1

产品方案对比

类别时空转录组时空多组学
产品方案时空转录FF时空转录组FFPE时空转录组大尺寸芯片时空蛋白转录组Stereo-CITE
捕获原理样本类型Poly-A 捕获随机探针捕获Poly-A 捕获Poly-A 捕获
检测组学信息RNARNARNARNA+蛋白

检测样本类型

Fresh FrozenFFPEFresh FrozenFresh Frozen

兼容染色方案

SSDNA染色、

H&E染色、

mIF染色(适用于1cm x 1cm)

ssDNA染色、

H&E染色

ssDNA染色、

H&E染色

DAPI染色
捕获面积

0.5 cm x 0.5 cm、

1 cm x 1 cm

1 cm x 1 cm

1 cm x 2 cm、

2 cm x 2cm、

2 cm x 3 cm可定制尺寸,最大到13 cm x 13 cm

1 cm x 1 cm
检测物种类型不限物种不限物种不限物种人、小鼠
扩展应用

转录组兼容组织形态学;

转录组兼容低通量蛋自检测;

空间单细胞分析

转录组兼容组织形态学;

微生物共检测;

非编码RNA共捕获;

空间单细胞分析

定制化尺寸、

空间单细胞分析

转录组兼容高通量蛋白检测
分析软件版本SAW v8.1、StereoMap v4.1SAW v8.1、StereoMap v4.1SAW v8.1、StereoMap v4.1

SAW v8.1、StereoMap v4.1

Stereo-seq时空组学技术

时空组学技术Stereo-seq(SpaTial Enhanced REsolution Omics-sequencing),基于DNA纳米球(DNA Nano Ball,DNB)开发,是具有高通量、超高分辨率、大视场的原位全景式技术,可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”同时进行空间转录组分析。该技术通过时空芯片捕获组织中的 mRNA,并通过时空条形码(Coordinate ID,CID)还原回空间位置,实现组织中基因空间表达检测,为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究基础。

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