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华大智造联合多个单位发布《2023海洋基因组学白皮书》,提供高效eDNA测序工具

时间:2023-11-01作者:华大智造阅读数:2271分享

10月28日-29日,2023年海洋基因组学会议暨海洋生物资源学术会议在青岛召开。会议上,华大智造联合深圳国家基因库、中德生态园以及华大生命科学研究院重磅发布《2023海洋基因组学白皮书》,助力全球海洋生态的保护和可持续发展。


本次会议以“海洋生物组学:科技驱动的海洋生物遗传资源研究与应用”为主题,交流海洋科技创新、基因科技未来产业发展的现状并探索未来发展趋势,分享海洋基因组学领域国际合作的实践经验,为基因科技未来产业发展蓄势聚能。



图1:《2023海洋基因组学白皮书》


相比2018年发布的首期白皮书,此次发布的《2023海洋基因组学白皮书》增加了近两倍的数据,微生物数据达到237Tb,基因组超24000个,全面描绘了现今海洋基因组学的发展趋势和研究方向,海洋生物基因组破译贡献度占全球28%、中国49%,研究成果将为相关科学研究及产业发展提供助益。


值得一提的是,由华大智造提供核心工具支撑的“千种海洋生物测序项目”在会议上宣布正式启动,该项目将开展千种海洋生物基因测序,为全球海洋生物资源的研究和保护贡献重要力量。华大智造将为该项目提供全流程的技术与设备支持,从样本保存、核酸提取、文库构建、高通量测序、到数据分析及存储所需的软硬件及试剂耗材等,为海洋生物基因组学研究全面赋能。


华大智造环境DNA宏条形码测序组合产品

为海洋基因组学研究提供高效工具


近年来,华大智造助力科研工作人员在海洋生物基因组学研究方面积极开展了多项项目,包括生物进化与发育、生物多样性与环境保护、海洋资源挖掘、海洋基因组与发育等,并取得了一系列突破性的成果。为了更加高效便捷地进行海洋的生物多样性发现和监测,助力环境污染和生态系统风险评估,华大智造开发出了一套基于环境DNA宏条形码(eDNA metabarcoding)测序的组合产品。



图2:华大智造环境DNA宏条形码测序组合产品


环境DNA技术是20 世纪以来生态环境领域最重要的革命性技术之一,它通过从环境介质(水、土壤、沉积物等)中提取DNA,对基因组的特定DNA片段进行PCR扩增和高通量测序,从而实现对生物群落的定性、定量分析。高通量测序的灵敏度优势可以实现环境中痕量DNA的检测。采用基于高通量测序的环境DNA技术,研究人员可以在一个样本中同时分析数千个物种。高通量测序与eDNA序列相关联的技术也被称为环境DNA宏条形码。


华大智造基于ATOPlex多重PCR技术和DNBSEQ测序开发环境DNA宏条形码测序组合产品,搭配自主研发的自动化样本制备系统与分析软件,可覆盖从样本存储到数据分析全流程,实现环境DNA一站式监测。华大智造独有的DNBSEQ测序技术,能够为eDNA的生信分析提供高质量的测序数据。


ATOPlex多重PCR 技术,是华大智造自主研发的超高重 PCR 核心专利技术,可针对目标区域进行引物设计,并提供Panel和建库试剂等一整套方案,实现精准高效的环境DNA宏条形码测序。华大智造环境DNA宏条形码测序组合产品可实现识别环境样本(水体、土壤和沉积物等)中的微生物、植物、藻类和动物种类,具有不损害生物机体、不受生物发育时期限制、灵敏度高、物种覆盖广、分析功能强大等特点,为生态环境基因组学研究和生物多样性监测提供强大工具支撑。






图3:DNBSEQ测序平台助力发布的海洋生物基因组学研究成果(部分)

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